Cada any la pluja fa que el riu Okavango, que en general arriba al seu nivell més alt al maig, creixi, i llavors l'aigua s'escampa i cobreix més de 13.000 km2. La crescuda anual del riu inunda extenses zones del nord del Kalahari, el que forma un aiguamoll temporal amb illes de pastura i palmeres. En anys de crescuda alta, l'aigua arriba a les depressions pantanoses de Makarikari, una enorme zona de pantans salobres a uns 200 km al sud-est, i els converteix en llacunes que proporcionen un refugi temporal a la fauna, sobretot a les grans bandades de flamencs .Encara que la majoria de les aigües desapareix en l'atmosfera seca i les terres àrides i sorrenques, queda prou quantitat per formar una xarxa de rierols cristal·lins, llacunes i pantans, que ràpidament converteixen el panorama en un verger amb una afluència massiva d'herbívors, que la seva vegada atrauen predadors com lleons i lleopards.
La vegetació aquàtica inclou atrapamosques o dionea (plantes que sura, atrapen i digereixen larves de mosquits) i densos llits de joncs i papirs que alberguen a sitatunga, un antílop semiaquàtic les peülles del qual estan adaptades per caminar en un terra tou i fangós. El blauet, el mussol pescador i el pigarg africà estan entre les més de 500 espècies d'aus al delta, juntament amb 160 espècies de rèptils, 40 espècies d'amfibis i 90 espècies de peixos.
